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ATAC-seq与CUTTAG都是利用TN5转座体的作用，这两...
ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing）是一种用于研究染色质开放区域（即易于转录因子和其他蛋白质结合的DNA区域）的技术。ATAC-seq利用一个被称为Tn5转座酶的蛋白质将测序接头插入到活跃的染色质区域，转座酶的作用导致DNA断裂，产生长度不等的DNA片段。
ATAC seq技术就是利用了改造后的 Tn5转座酶 ，并将转座DNA设计为接头序列，这样便可以通过 “剪切” 和 “粘贴” 的方式，直接将测序接头引入到开放的染色质中，进行捕获测序。
要想知道ATAC-seq的作用，首先必须知道染色质的结构，以human为例，有一定molecular biology背景的人都知道，人类的DNA并不是裸露的，长度惊人的DNA链是以一种特殊的结构被“收纳”在细胞中的：DNA缠绕在组蛋白上，形成串珠式的结构。
原核生物的转座分为两种方式，复制转座和保守转座。复制转座的供体DNA完整，把通过复制的DNA片段插入基因位点上；保守转座则是从供体DNA上分离一段DNA，以转座酶作为中介，连接到目标DNA上而实现的 （又被成为 cut and paste 转座）。Tn5是极好的模型来研究保守转座模式。
转座子：一段可以从原位上单独复制或断裂下来，环化后插入另一位点，并对其后的基因起调控作用的DNA序列。转座酶：能把转座子从相邻序列中脱离出来。极活跃的Tn5转座酶 能 将测序接头插入到染色质可接近区域 。而染色质其他区域和组蛋白紧密结合，以核小体的形式存在，转座酶不能作用于非开放区域。
通过添加含有镁离子的反应液使Tn5转座酶开始发挥作用，这里面的细节可以参考我前面的帖子 组学技术——ATAC-seq 。
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